Gimė 1952 m. gegužės 10 d. Rukų kaime, Šilutės rajone (dabar – Pagėgių savivaldybėje). Habilituotas chemijos mokslų daktaras, profesorius. 1969 m. baigė Pagėgių vidurinę mokyklą ir įstojo į Vilniaus universiteto Chemijos fakultetą, kurį 1974 m. baigė. Pradėjo dirbti šio fakulteto Bendrosios chemijos katedros vyr. laborantu, 1976 m. pradėjo eiti Fizikinės chemijos katedros jaunesniojo mokslinio bendradarbio pareigas. 1977-1978 m. dirbo šios katedros vyr. moksliniu bendradarbiu, o 1978-1988 m. – Fizikinės chemijos katedros dėstytoju asistentu. 1980 m. apgynė daktaro (tuomet – mokslų kandidato) disertaciją apie sidabro elektrolitinių lydinių nusodinimą. 1982-1983 m. stažavosi Kentukio universitete (JAV). 1988-1998 m. – naujai įkurtos Bendrosios ir neorganinės chemijos katedros vedėjas docentas. 1995 m. mokslinį darbą dirbo Šiaurės Vakarų universitete (JAV), 1998-1999 m. – Orhuso universitete (Danija). 1997-2009 m. dirbo Vilniuje įsikūrusiame Studijų kokybės vertinimo centre (tai nebuvo pagrindinė darbovietė) Studijų vertinimo skyriaus vedėju, vėliau – vyriausiuoju specialistu, organizavo mokslo ir studijų ekspertinį vertinimą. 1998-1999 m. buvo Europos Sąjungos PHARE programos „Lietuvos aukštojo mokslo reforma“ darbo grupės „Studijų kokybės užtikrinimas ir vertinimas“ vadovas. 1998 m. Vytautui Daujočiui suteiktas habilituoto mokslų daktaro laipsnis, o 1999 m. – profesoriaus vardas. 2001-2006 m. kaip ekspertas atstovavo Lietuvai dalyvaudamas Europos Komisijos projektuose „Nacionalinių politikos gairių nustatymas ir derinimas mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros srityje“, „Europos išskirtinių mokslo centrų žemėlapio sudarymas“, „Skatinti valstybinių mokslo centrų ir universitetų reformą, siekiant gerinti žinių perdavimą visuomenei ir pramonei“, įgyvendintuose kuriant Europos mokslinių tyrimų erdvę. 2003–2007 m. buvo Lietuvos mokslo tarybos nariu, dabar – Studijų vertinimo komisijos (patariamosios institucijos prie Studijų kokybės vertinimo centro) narys. Buvo 2004 m. įkurtos nevyriausybinės organizacijos – piliečių judėjimo „Kitas pasirinkimas“ valdybos narys ir šios organizacijos laikraščio „Baltijos kelias“ redakcinės kolegijos narys. Iki šiol eina Vilniaus universiteto Chemijos fakulteto Bendrosios ir neorganinės chemijos katedros profesoriaus pareigas.
Sukūrė tris sidabro lydinių elektrocheminio nusodinimo būdus.
Svarbiausi darbai padaryti tiriant krūvio pernašos ir pasiskirstymo elektrocheminėse sistemose, superlaidininkų sintezės bei skysčių, tekančių vamzdžiais, ypatybes. Paskelbė daugiau negu 60 mokslinių publikacijų. Vytautas Daujotis yra vienas iš „Olimpiadinio chemijos uždavinyno“ (1979 m.) sudarytojų ir vienas iš mokomosios priemonės „Fizikinės chemijos laboratoriniai darbai“ (1986 m.) bei knygų „Organinės chemijos skaitiniai“ (1994 m.), „Lietuvos mokslo politika Europos kontekste“ (2002 m.), „Nepriklausomos Lietuvos aukštojo mokslo vargdenė“ (2012 m.) bendraautorių (V. Daujotis yra pastarosios knygos ne tik bendraautorius, bet taipogi ir sudarytojas). Vytauto Daujočio žmona Dalia Daujotienė (Raupėnaitė) 2001 m. mirė. Duktė Dalia Daujotytė – biochemikė.
Naudoti informacijos šaltiniai:
Lietuva: enciklopedija. [T.] 2: biografijos: A – I [vyriausioji redakcija: vyriausiasis redaktorius Antanas Račis … [et al.]. Vilnius: Mokslo ir enciklopedijų leidybos centras, 2010. 798, [2] p. ISBN 978-5-420-01667-1. ISBN 978-5-420-01639-8 (klaidingas).
ŠILUTĖS RAJONO SAVIVALDYBĖS FRIDRICHO BAJORAIČIO VIEŠOJI BIBLIOTEKA. Šilutės kraštas: enciklopedinis žodynas. Šilutė: Prūsija, 2000. 496, [24] p. ISBN 9986-798-05-1.
2012 m. spalio 14 d. Lietuvos Respublikos Seimo rinkimai: Vytautas Daujotis [interaktyvus]. Vilnius: Lietuvos Respublikos vyriausioji rinkimų komisija, 2014 [žiūrėta 2015 m. rugsėjo 23 d.]. Prieiga per internetą: <http://www.vrk.lt/statiniai/puslapiai/rinkimai/416_lt/Kandidatai/Kandidatas66667/
Kandidato66667Biografija.html>.
Nuotrauka iš Lietuvos Respublikos vyriausiosios rinkimų komisijos interneto svetainės www.vrk.lt